(Bitsliced Genomic Signature Index (BIGSI- מנוע חיפוש חדש ל- DNA    של חידקים וווירוסים

כמות נתוני רצף גנטי של מיקרואורגניזם – חיידקים ווירוסים שמאוחסנים בבסיסי נתונים ברחבי העולם גדלה והולכת. מנוע החיפוש חדש BIGSI,  שמהווה שילוב בין מידע זה וטכנולוגיות חיפוש מתקדמות, מאפשר חיפוש במאגרי נתונים אלה. בכך מאפשר לתרגם נתונים גנטיים לתובנות, להבין טוב יותר מחלות , עמידות לאנטיביוטיקה וכו',. מנוע חיפוש פותח על ידי חוקרים מ- EMBL's European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI . נכון להיום מנוע החיפוש כולל באינדקס שלו 447,833 סטים של נתוני רצף גנטי ויכול לגדול למיליוני סטים של נתונים.

חיפוש באינדקס אפשרי בכתובת http://bigsi.io

מאמר בנושא פורסם לאחרונה ב- Nature Biotechnology . מידע על המנוע אפשר למצוא  בכתובות שלהלן:

https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2017/12/18/234955.full.pdf

https://phys.org/news/2019-02-web-genomics-dna-microbes.html

doi: 10.1038/s41587-018-0010-1

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/234955v2

 

.

מודעות פרסומת

אודות information-world

ד"ר יפה אהרוני , מידענית
פוסט זה פורסם בקטגוריה כללי, מנועי חיפוש. אפשר להגיע ישירות לפוסט זה עם קישור ישיר.

להשאיר תגובה

הזינו את פרטיכם בטופס, או לחצו על אחד מהאייקונים כדי להשתמש בחשבון קיים:

הלוגו של WordPress.com

אתה מגיב באמצעות חשבון WordPress.com שלך. לצאת מהמערכת /  לשנות )

תמונת גוגל פלוס

אתה מגיב באמצעות חשבון Google+ שלך. לצאת מהמערכת /  לשנות )

תמונת Twitter

אתה מגיב באמצעות חשבון Twitter שלך. לצאת מהמערכת /  לשנות )

תמונת Facebook

אתה מגיב באמצעות חשבון Facebook שלך. לצאת מהמערכת /  לשנות )

מתחבר ל-%s