HiPub – תוסף חינמי לדפדפן גוגל כרום לזיהוי ישויות ב- Pubmed ו- Pubmed Central והצגת מידע נוסף

מדי יום נוספים למאגר הביו-רפואי  Pubmed  למעלה מ- 3000 תקצירים. גם לחוקר בתחום  צר קשה לעקוב אחר הקשרים בין המאמרים השונים. לדוגמה  חוקר מעוניין לדעת אם גן חדש,  שמתואר במאמר מסוים במאגר,  קשור לתחום המחקר הספציפי שלו  – ייקח לו הרבה זמן לענות על השאלה.

bioinformatics-2כעת תוסף תוכנה – plug in – חופשי חדש מיוחד לכרום –   HiPub , יכול לתת במהירות מענה לשאלה. התוסף, עליו פורסם  לראשונה ב– 2 באוגוסט 2016 בכתב העת bioinformatics, פותח באוניברסיטת קולורדו בשיתוף עם קולגות באוניברסיטת קוריאה. על פי המתואר  HiPub  מבצע כרית טקסט , מזהה ישויות – גנים, חלבונים, תרופות/כימיקלים  ומחלות  ומציג את הקשרים בצורה ויזואלית  בהקשר הביולוגי שלהם.

plug1

פרטים נוספים על תוסף התוכנה , קישור להורדה  ומדריך למשתמש אפשר  למצוא בכתובת: http:// hipub.korea.ac.kr

כאשר בדקתי את הקישור בדפדפן כרום במחשב האישי – ההורדה הייתה קלה מהירה ואוטומטית. לאחר מכן כאשר נכנסתי ל- HiPub  , Pubmed פעל  באופן אוטומטי. הציג לי את התקציר וצבע ישויות בצבעים שונים, ייחודיים לישות המסוימת – לדוגמה: גן בצבע סגול, מחלה בצבע כתום, חומר כימי בצבע ירוק .  כאשר עמדתי על המונח הוא הציג את השם המועדף . לחיצה על המונח הציגה עליו מידע נוסף וקישורים רלוונטיים. לא הגעתי למפה ויזואלית של קשרים כפי שמתואר במאמר. גם כך המידע המוצג מסייע מאוד.

plugin3 copy

הסרת התוסף, למי שמעוניין לאחר התקנתו, היא ככול הסרת התוספים מגוגל כרום. בתפריט בצד ימין למעלה –  more tools- extensions ולאחר מכן   בחירה ב-Hipub והסרתו.

אין ספק, התוסף מדגים את היכולות של כריית טקסט  וחשיבותה לחוקר.

מודעות פרסומת

אודות information-world

ד"ר יפה אהרוני , מידענית
פוסט זה פורסם בקטגוריה כלי מחקר, כלים, תוכנות. אפשר להגיע ישירות לפוסט זה עם קישור ישיר.

כתיבת תגובה

הזינו את פרטיכם בטופס, או לחצו על אחד מהאייקונים כדי להשתמש בחשבון קיים:

הלוגו של WordPress.com

אתה מגיב באמצעות חשבון WordPress.com שלך. לצאת מהמערכת / לשנות )

תמונת Twitter

אתה מגיב באמצעות חשבון Twitter שלך. לצאת מהמערכת / לשנות )

תמונת Facebook

אתה מגיב באמצעות חשבון Facebook שלך. לצאת מהמערכת / לשנות )

תמונת גוגל פלוס

אתה מגיב באמצעות חשבון Google+ שלך. לצאת מהמערכת / לשנות )

מתחבר ל-%s